กรมควบคุมโรค มีเป้าหมายการดำเนินงานเพื่อป้องกันและควบคุมการแพร่ระบาดของโรคต่างๆ จึงได้ปรับเปลี่ยนโครงสร้างองค์กรครั้งสำคัญโดยมีการตั้งศูนย์บริหารกิจการนวัตกรรมเฉพาะกิจขึ้นเพื่อให้เป็นพื้นที่ทดลอง สื่อสาร และดำเนินงานนวัตกรรมให้ครอบคุมทั่วทั้งองค์กร
